한국해양수산개발원 30년사는 이미지화보, 연혁화보, 회고와 기대, 현황화보, 연구사, 부록으로 구성했다. 통사는 4개 기관이 통합하기까지 역사를 약술했고, 회고와 기대는 전임 원장, 임직원, 해외 인사의 원고를 담았다. 연구사는 업무 이해도가 높은 내부 집필자의 원고로 구성했다.